Visi sebagai penggerak Institut Injil Indonesia adalah “menjadi institusi pendidikan tinggi teologi injl yang profesional di bidang misi holistik global.” Tujuannya adalah adalah mendidik Sumber Daya Manusia untuk berdaya guna secara profesional dalam pelayanan misi holistik global; melakukan penelitian secara profesional dalam bidang pelayanan misi holistik global; melekukan pengabdian masyarakat melalui jalur profesional dalam pelayanan misi holistik global.
Institut Injil Indonesia (I-3) membuka kesempatan kepada setiap orang yang terpanggil melayani dalam ladang-Nya. Oleh sebab itu, I-3 menyediakan program-program pendidikan Stratum 1 sebagai berikut:
1. Fakultas Teologi, Program Studi: Teologi
2. Fakultas Pendidikan Agama Kristen, Program Studi: Pendidikan Agama Kristen
3. Fakultas Misiologi, Program Studi: Misiologi
Sebagai wujud tanggung jawab Institut Injil Indonesia terhadap pedidikan, ketiga fakultas tersebut telah terakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi. Dengan demikian, lulusan yang dihasilkan oleh Institut Injil Indonesia dapat diterima dalam dunia profesional.